Padre Manuel Paiva desembarcou na Bahia e foi trazido para São Paulo do Piratininga para favorecer o entendimento entre a igreja e seu primo João Ramalho.
Em 1554, organizou a construção do Colégio de São Paulo de Piratininga com a ajuda de alguns portugueses e dos índios tupiniquins.
Em 25 de janeiro de 1554, o Padre Manuel Paiva, rezou a missa que data a fundação de São Paulo de Piratininga, tendo como ajudante o Padre José de Anchieta. Por esse feito, tornou-se o padre superior do Colégio São Paulo com a responsabilidade da administração.
Foi o primeiro Capelão Militar do Brasil, por caminhar com uma tosca cruz na batalha travada durante a tentativa dos índios destruírem o Colégio São Paulo. Após este ato, ele foi indicado como o jesuíta capaz de contatar e aldear os índios que viviam na região e que não queriam contato com o português.
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por: Eduardo do Nascimento